Я пока проблему не наблюдаю, если есть возможность — повторите действия и напишите мне. или сюда со ссылкой, чтобы можно было проветрить.
по идее в теме считаются новые для Вас комменты.  

Как пример работы информера: http://prorc.userecho.com/topic/194336-informer-kolichestva-kommentariev/

Что касается комментариев, намного лучше при открытии страниц видеть не ссылки разделов с вопросиками, а еще и указание числа сделанных записей. А то зашел в модель, а там разделы, но приходится перещелкивать их, так как не понятно, есть ли блог у модели и комментарии…